②禽畜粪便、污水中 ， 含有大量的氮、磷等营养元素 ， 会导致水体富营养化 ， 并且在禽畜养殖过程中 ， 会产生大量氨气、硫化物、甲烷等有毒气体 ， 从而对大气环境造成污染 。
③禽畜废弃物之中 ， 病原微生物以及寄生虫卵的数量众多 ， 如果不加处理 ， 有可能会引起人畜传染病 ， 威胁到人畜健康安全 。
2、水资源短缺
（1）我国人均水资源量仅为世界平均水平的四分之一 ， 是世界上人均水资源最为贫乏的国家之一 。其中我国农业用水量占据总用水量的65% ， 而农业灌溉用水用量占据农业用水用量的90%以上 。
（2）我国季风性突出 ， 半干旱地区较多 ， 全国大约为三分之二的耕地需要进行灌溉 ， 并且近年来由于工业发展和农业灌溉 ， 导致地下水被过度开发 ， 引起地下水位下降 ， 地面下沉 ， 江河倒流 ， 海水倒灌等一系列现象 。
（3）除开水资源短缺以外 ， 我国农业灌溉用水浪费情况十分严峻 ， 利用率普遍不高 ， 其中农业灌溉用水的有效利用系数仅为0.475 ， 自然降水的利用率仅为56% 。
3、农业资源利用率低
（1）我国农业发展基本沿用资源-产品-废弃物排放单线流动的粗放经营的增长方式 ， 其资源利用率低 ， 排放高 ， 消耗高 。
（2）据统计 ， 我国每年大约有5亿吨秸秆 ， 1000万吨米糠 ， 1000万吨玉米芯 ， 2000万吨稻壳等副产品被视作农业废弃物 ， 堆放在田边、路边或进行焚烧 ， 不仅造成资源浪费 ， 同时会对环境造成污染 。
4、有效耕地面积以及耕地质量下降
（1）1996年 ， 我国耕地面积为19.51亿亩 ， 2011年 ， 我国耕地面积下降至18.26亿亩 ， 同时人均耕地面积也从10余年前的1.58亩降低至1.38亩 ， 仅为世界平均水平的40% 。
（2）根据2009年12月24日发布的耕地质量等级调查与评定结果 ， 我国生产能力大于1000kg/亩的耕地仅为6.09% ， 并且盐碱地、红壤秋林、风沙地、干旱地、水土流失地、旱涝地、涝洼地等低产田占据耕地总面积的三分之一 。
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