另一方面，地球上的原始生命也对大气层进行了大幅度的改造，在大约34亿年前，地球上就演化出了能够进行光合作用的蓝细菌，它们在地球的海洋中大量地繁殖，并利用太阳光的能量不断地将二氧化碳和水合成自己的生命物质，然后将它们的生命活动产生的“废料”——氧气排放到大气层中 。
在上述两种机制的共同作用下，地球大气层的中的二氧化碳和甲烷就变得越来越少（注：甲烷会被氧气氧化，并生成二氧化碳和水），于是大气层中就留下了大量的氮气和氧气，这也就是现在地球大气层中的主要成分，在此以后，地球上出现了能够进行有氧呼吸的生物，并逐渐演化出多姿多彩的生命 。
总而言之，地球的大气层之所以可以完美地适应生命，除了地球特殊的位置（相对与太阳）以外，地球上的原始生命（例如蓝细菌）也是一个必不可少的因素，在它们的努力之下，地球才拥有了太阳系中独一无二的大气层，并最终成为了一颗充满生机的行星 。
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