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慢性炎症身体存在长期的慢性炎症是引起肛门直肠炎的原因之一，例如慢性细菌感染、慢性非特异性结肠炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变 。此外，痔疮、肛瘘、肛裂、毛囊炎等长期刺激肛门皮肤 ， 也可引起炎变 。
慢性炎症的感染患有结肠炎的患者大部分与慢性炎症的感染有关 。如长期受到慢性细菌感染，阿米巴痢疾，慢性非特异性结肠炎，等慢性疾病的刺激使得粘膜发炎病变，假息肉等一些症状发生炎症感染所致 。
异物损伤还有由于异物损伤所引起的直肠炎，这种病因比较常见 ， 因为直肠受到如硬东西 ， 骨片，未消化的木片，和其他一些坚硬的食物碎渣，带有棱角的食物等都会刺激损伤粘膜，而引起直肠炎 。还有的是大便干结时 ， 由于拉出的大便很硬就会使粘膜受到损伤而导致直肠炎 。
性病也会导致直肠炎【直肠炎是怎样形成的 直肠炎的危害】由于不洁的肛交，使肛门处感染上尖锐湿疣或者其他的纤维瘤等，就会引起病变 ， 炎症，受到强烈的刺激摩擦 ， 发生感染就会导致直肠炎的发生 。还有一些原因是遗传基因的因素造成的，还有很多其他的病因如长期受到痔疮，肛瘘，肛裂，或者良性肿瘤的恶变等等原因 。
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