二者在住院报销方面有所差别：
【农村合作医疗一档和二档的区别 农村合作医疗一档和二档的区别是什么】(一)一档缴费的，在实施基本药物制度的一级医院发生的住院医疗费用按80%支付(基本药物按90%支付) ， 在未实施基本药物制度的医院住院的按60%支付;二级医院按58%支付;三级医院按45%支付 。
(二)二档缴费的，一级医院按85%支付(基本药物按90%支付)，二级医院按70%支付 ， 三级医院按60%支付 。
二者在住院报销方面有所差别：
【农村合作医疗一档和二档的区别 农村合作医疗一档和二档的区别是什么】(一)一档缴费的，在实施基本药物制度的一级医院发生的住院医疗费用按80%支付(基本药物按90%支付) ， 在未实施基本药物制度的医院住院的按60%支付;二级医院按58%支付;三级医院按45%支付 。
(二)二档缴费的，一级医院按85%支付(基本药物按90%支付)，二级医院按70%支付 ， 三级医院按60%支付 。
