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疾病因素1、可能是灰指甲前期由甲沟炎感染上真菌引起的灰指甲，会出现甲面有大大小小的凹点以及沟纹，看着像指甲布满了密密麻麻的小坑一样，若不及时治疗 ， 之后真菌会波及甲板，出现裂纹、变脆或增厚，呈棕色或黑色 。
2、可能是真菌感染所致的其他皮肤病这个灰指甲引起的病因类似，都是由于真菌感染所致，但患者除了会出现指甲有密密麻麻的小坑外 ， 还会出现皮肤其他地方有瘙痒，粗糙的现象，多半是先因皮肤感染真菌后 ， 波及指甲也感染了真菌 ， 如：头癣、股癣、体癣、手足癣、指甲癣等病情 。
3、可能患有低氧血症低氧血症是指血液含氧量不足，致使末梢组织血液循环缺氧，引起指甲的营养代谢障碍 ， 当指甲缺少生长所需营养时，就会发生指甲凹陷，形成密密麻麻的小坑 。
非疾病因素1、可能是长期浸泡在含有化学物质的水中导致长期浸泡在水里的指甲 ， 容易被水泡软，甚至腐蚀，这就好比长期泡在有腐蚀性水里的石头一样，会逐渐变得坑坑洼洼的，指甲也是一样的，它只是比皮肤稍微坚硬一点，但若是长期浸泡在含有某些化学成分的水中 ， 会逐渐长有密密麻麻的小坑，同时手部皮肤也会出现脱皮等症状 。
一般这类人群以家庭主妇、美容美发、建筑工人、从事某些化学配制的人群居多 。
2、可能是缺乏营养导致指甲和人体其他器官一样 ， 一旦身体过度缺乏某些营养物质，就会出现异常生长现象，如指甲竖纹、横纹、分层、有白点、有密密麻麻的小坑、凹凸不平等症状 。
3、可能跟经常干重体力活有关指甲长有密密麻麻的小坑，可能跟患者平时多做重体力的劳作活动有关，因为长时间用手干重体力活 ， 会导致指甲受力过大，指端耗氧量增加，逐渐出现指端缺氧的状态 ， 出现指甲供血不足，导致长有密密麻麻的小坑 。
4、跟佩戴人工指甲有关很多爱美的女性，在做美甲时 ， 有时会用到人工指甲，这些人工指甲上涂抹指甲油，而且镶嵌在原来的指甲上，若不注意清洁卫生，很容易附着大量细菌在指甲上导致指甲感染发病 ， 长有很多小孔 。
5、可能跟自身肠胃不好有关另外身体若肠胃不好，即使吃的方面很有营养，不缺少什么 ， 也会因肠胃不吸收而导致缺乏营养的问题，最后影响到指甲的生长，表现出指甲长有小坑等异常现象 。
6、可能是高原反应导致高原地区水温较低，手指长期与冷水接触，导致末梢血管痉挛出现指甲有密密麻麻的小坑，同时还可能会伴有指甲扁平，粗糙，光泽减退等症状，严重时指甲呈齿状 。
指甲有密密麻麻的小坑怎么办1、疾病因素解决办法建议指甲有密密麻麻小坑症状的患甲赶紧到医院做真菌检测，如确诊是由灰指甲引起的，需在及时治疗 ， 可口服、外用药物或拔甲进行治疗，通常脚趾甲出现的灰指甲病情，治愈需要3—6个月不等的时间，要坚持治疗 。
2、非疾病因素解决办法（1）补充营养
日常均衡膳食，补充营养，多吃含钙丰富和蛋白质丰富的食物，补充指甲生长所需的营养元素，如：鸡蛋、牛奶、牛肉、鸡肉、豆制品等食物 。必要时就医检测自身微量元素，看具体缺乏哪种微量元素，然后加以补充 。
（2）戴手套工作
建议平时戴好双层手套进行工作，里面是棉质手套 ， 外面是防水的橡胶手套，避免双手直接在水中浸泡太久，保护指甲和手部 。
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